(一)選地搭棚
立體栽培紫紅木耳的大棚易搭建在近水源、地勢平坦、背風向陽、環境清潔的農田或庭院。大棚長25米、寬8米，四周及棚頂先蓋1層厚膜，膜上再蓋1層遮陽網或草簾或玉米高梁秸。棚頂間距4米設置1個長1.5米、寬1.5米、高0.8米的排氣窗，棚內光線以能看書讀報為宜。也可利用現成的蔬菜大棚或日光溫室。
(二)培養料配制
(1)配方：1)草秸屑80%，玉米混合粉15%，復合肥2%，石膏粉、石灰粉、食鹽各1%，固氮菌肥0.3%，水130%(含水量60%左右)。2)
雜木屑85%，麩皮10%，復合肥2%，石灰粉、食鹽各1%，固氮菌肥0.3%，水130%。3)棉籽殼60%，雜木屑30%，玉米混合粉8%，石灰粉2%，固氮菌肥0.3%，水145%。
(2)配料：分別按比例稱量，置拌料場地面。石灰粉，食鹽和固氮菌肥先溶于水，其它料干拌混勻，澆入食鹽水、石灰水和固氮菌肥水播拌均勻，檢查培養料含水量60%左右，上堆發酵，中途翻堆3-5次。
(3)裝袋滅菌：用20×50×0.05厘米的聚丙烯筒膜裝料，每袋裝干料約1公斤，濕重2.5公斤左右，袋兩頭套環塑膜封口，膠圈扎緊。裝完后放入太空滅菌包內滅菌4-5小時，燜1夜后取出，也可放入常壓滅菌鍋內，在蒸氣溫度100攝氏度條件下保持8-10小時，燜1夜后出鍋。
(三)接種培養
用"四不型"食用菌無菌接種器，2人相互配合將紫紅木耳木粒菌種植入滅菌后的料袋兩頭，每頭各接植木粒菌種7-10粒，封口改用報紙，膠圈扎實。接種完后置大棚地面，立體疊袋5-7層，進行發菌培養，用覆蓋塑膜或覆蓋塑料編織袋或降低疊袋層的方法，棚內空氣相對濕度70%左右，5-7天播袋一次，一般30-40天菌絲可長滿全袋。
(四)出耳管理
菌絲長滿袋后，去掉袋兩頭封口報紙，地面潑水和空間噴霧水逐漸提高空氣相對濕度達85%-95%。打開排氣窗增加通風換氣，調控棚內溫度20-35攝氏度之間，給予散射光照，進行催蕾出耳管理。耳芽生成后，增加噴霧水次數和通風量，使耳片從袋兩頭膨大生長，7-8成熟時采收，可采4-5潮，生物轉化率250%-350%。
